Les molécules sont des composés dans lesquels les éléments sont dans des ratios définis et fixes, comme on le voit dans la figure 12. Ces atomes sont généralement maintenus ensemble par l`un des trois types d`obligations chimiques discutés ci-dessus. Par exemple: eau, glucose, ATP. Les mélanges sont des composés avec des formules/ratios variables de leurs composants. Par exemple: sol. Les formules moléculaires sont une expression dans les termes de nombre entier les plus simples de la composition d`une substance. Par exemple, la glycémie a 6 atomes de carbone, 12 hydrogènes et 6 oxygènes par unité structurale répétitive. La formule est écrite C6H12O6. Alberts B, Johnson A, Lewis J, et coll.

biologie moléculaire de la cellule. 4ème édition. New York: Garland science; 2002 les modèles englobent un large éventail de degrés de précision et d`ingénierie: certains modèles tels que l`eau de J.D. Bernal sont conceptuels, tandis que les macromodelles de Pauling et de Crick et de Watson ont été créées avec beaucoup plus de précision. Les modèles moléculaires ont inspiré les graphiques moléculaires, d`abord dans les manuels et les Articles de recherche et plus récemment sur les ordinateurs. Les graphismes moléculaires ont remplacé certaines fonctions des modèles moléculaires physiques, mais les kits physiques continuent d`être très populaires et sont vendus en grand nombre. Leurs atouts uniques sont: avec le développement de la modélisation physique par ordinateur, il est désormais possible de créer des modèles complets en une seule pièce en alimentant les coordonnées d`une surface dans l`ordinateur. La figure 6 montre les modèles de toxine de l`anthrax, à gauche (à une échelle d`environ 20 Å/cm ou 1:5 000) et de protéines fluorescentes vertes, à droite (de cinq centimètres de haut, à une échelle d`environ 4 Å/cm ou 1:25000000) de 3D Molecular Design. Les modèles sont faits de plâtre ou d`amidon, en utilisant un processus de prototypage rapide. Les macromolécules sont abondantes dans les cellules. La composition approximative d`une cellule bactérienne est indiquée en poids. La composition d`une cellule animale est similaire (voir le tableau 2-4).

La structure du glucose, un sucre simple. Comme illustré précédemment pour l`eau (voir la figure 2-12), toute molécule peut être représentée de plusieurs façons. Dans les formules structurelles indiquées en (A), (B) et (E), les atomes sont représentés sous forme de symboles chimiques reliés entre eux (plus…) Le quatrième effet qui peut jouer un rôle important dans l`apport de molécules ensemble dans l`eau est une force hydrophobe. Cette force est causée par une poussée des surfaces non polaires du réseau d`eau lié à l`hydrogène, où elles interfèrent physiquement avec les interactions très favorables entre les molécules d`eau.