Το χωριό αρχικά βρισκόταν στη θέση ' Αγιος Σπυρίδων, προς τον Κοντιά. Εκεί σήμερα υπάρχουν κατάλοιπα ενός παλιού νεκροταφείου. Οι κάτοικοι εγκατέλειψαν το παλιό χωριό πριν 280 χρόνια, κατά τον Ν. Λυμπέρη, λόγω μιας επιδημίας χολέρας.
Βλέπουμε πως και σ' αυτό το χωριό επαναλαμβάνεται η παράδοση για επιδημία χολέρας στο νησί, γύρω στα 1700. Βέβαια ο χρονικός προσδιορισμός της είναι αμφισβητήσιμος. Πιθανότατα, όλες αυτές οι κοινές παραδόσεις περί επιδημίας, να προήλθαν από την επιδημία πανούκλας που έπληξε το νησί το 1349-50.
Τ' όνομα Πορτιανού έχει λατινογενή προέλευση, από τις λέξεις porto juno, δηλαδή νέο λιμάνι. Το λιμάνι αυτό έφτιαξαν οι Ενετοί στην κοντινή παραλία στα Ν.Α. του παλιού χωριού, όπου σώζεται κι ενετικός πύργος.
Στο Πορτιανού στρατοπέδευσαν οι συμμαχικές δυνάμεις το 1915 κατά την εκστρατεία της Καλλίπολης. Οι νεκροί της τραγικής αυτής εκστρατείας θάφτηκαν σε συμμαχικό νεκροταφείο, που υπάρχει ακόμα στο χωριό.