Modèle de circularisation clients
L`évolution orbitale naît par le transfert de l`énergie orbitale aux modes d`oscillation. Les transferts à des passages successifs du périastron conduisent à une circularisation orbitale. C`est le cas, soit lorsque l`énergie du mode est dissiée directement entre les rencontres, ou lorsque le système est dans le régime de l`instabilité stochastique. Nous avons comparé la contribution associée aux modes inertiels avec la contribution associée aux modes fondamentaux, dans un état de Pseudo-synchronisation, à l`échelle temporelle de circularisation dans la section 7. Nous avons constaté que les modes inertiels ont conduit à une circularisation efficace d`une planète géante avec une masse d`environ 1mJ sur une échelle temporelle plus petite que ou de l`ordre de quelques Gyr, lorsque l`axe initial de demi-grand était inférieur à 10 UA et la période orbitale finale après la circularisation PorB < 6 d. Dans ce cas, les modes inertiels jouent le rôle le plus important à des périodes plus longues. Cependant, les vagues inertielles sont moins importantes pour les planètes de plus grande masse 5MJ que nous avons envisagé. Dans ce cas, les marées dynamiques exercées sur l`étoile étoile centrale, que nous avons supposé être solaire comme, jouent un rôle majeur. Ll. LtrB épissage par circularisation, à partir d`une population de mRNAs interrompus par l`intron, génère des fragments d`ARNm traités qui IBS1 des séquences similaires à leur extrémité 3 ` (Fig 5B, étape 3A et 3b). Nous avons ensuite examiné si ces produits d`épissage pouvaient être recrutés par ll. LtrB, de même que l`E1 libre par l`appariement de base EBS-IBS, et utilisé pour générer des chimères intergéniques mRNA-mRNA (Fig 9). Nous avons détecté par RT-PCR à la fois alaS-enoA (Fig 7I) et enoA-alaS (Fig 7J) mRNA-ARNm chimères intergéniques jointes à des séquences spécifiques de IBS1/2 pour LL.
LtrB-ΔLtrA + LtrA mais pas pour le LL. LtrB-ΔA-ΔLtrA + LtrA. Ces données montrent que le LL. LtrB, épissé à l`envers dans divers mRNA, peut recruter par l`appariement de base des fragments traités d`ARNm, en IBS1 des séquences similaires à leur extrémité 3, pour initier la voie d`épissage de la circularisation (Fig. 9, étape 2). Ll. LtrB peut ainsi catalyser le brassage des séquences de codage dans une population d`ARNm interrompus par l`intron par une nouvelle voie intergénique de trans-épissage (Fig. 9). (a) indépendant LL. les événements d`épissage inverse du LtrB ont été identifiés par des ARN-SEQ totaux pour LL. LtrB-ΔLtrA + LtrA, LL. LtrB-EBS1/Mut-ΔLtrA + LtrA et le contrôle LL.
LtrB-ΔA-ΔLtrA + LtrA qui épissent exclusivement par la voie de circularisation et Épissure. Les interactions de couplage de base EBS1-IBS1 et EBS2-IBS2 pour LL. LtrB-ΔLtrA + LtrA (b) et ll. LtrB-EBS1/Mut-ΔLtrA + LtrA (c) sont représentées. Des représentations de logos des séquences de consensus en amont (15 NTS) et en aval (15 NTS) des sites d`épissage inversé de l`intron dans les différents mRNA de L. lactis sont également montrées. Nos résultats indiquent que les mRNA cellulaires peuvent en quelque sorte être incorporés à la jonction de l`épissure du cercle LL. LtrB pendant la voie de circularisation. Deux modèles peuvent expliquer comment des fragments d`ARNm pourraient être incorporés à la jonction d`épissure des cercles d`intron du groupe II (Fig. 5). À l`expression des gènes interrompus par l`intron du groupe II dans les bactéries, les ribozymes s`épissaient à l`aide de la voie de ramification conventionnelle, libérant un mélange de RNPs (lariats + LtrA) et d`exons flanqués avec précision (étape 1). Les RNPs excisés interagissent ensuite avec les transcriptions de l`ARNm cellulaire grâce à un appariement de base spécifique avec des séquences de IBS1/2 (— | —).
Cette interaction conduit soit à compléter l`épissage inverse ou l`hydrolyse sur les sites de IBS1/2, produisant une population de transcriptions d`ARNm envahies par l`intron ou des fragments d`ARNm hydrolysés avec un 3 `-OH libre, respectivement (étape 2). Lorsque des introns interrompent un auto-épissure de site ectopique à l`aide de la voie de circularisation, ils recrutent soit des fragments d`ARNm ectopiques transformés, soit leur apparenté traité E1, qui peut agir comme nucléophiles externes dans une réaction de trans-épissage intergénique ( étape 3). Ceci produit deux populations distinctes de transcriptions de l`ARNm chimérique: l`ARNm-E1 et les produits mRNA-mRNA, qui augmentent ensemble la diversité globale du transcriptome de l`hôte bactérien.