Les recherches actuelles ont été financées par un important projet de recherche (MRP/F., no 40-137/2011 (SR) daté du 04-07-2011), financé par la University Grants Commission (UGC) (New Delhi). Mme Deepmala Satpathy a reçu une bourse de recherche de projet de la MRP. Pour les DCs des tissus périphériques, les organes ont été digérés en collagénase D (roche) et en DNase I (Sigma-Aldrich) pendant 1 h à 37 ° c avec agitation dans 5 ml de cIMDM. Les cellules hépatiques ont été séparées à l`aide d`un gradient Percoll (Sigma-Aldrich). Des suspensions d`intestin grêle ont été préparées comme décrit précédemment (Satpathy et al., 2013). Données de microarray précédemment générées dans notre laboratoire (GEO accession nos {«type»: «entrez-Geo», «attrs»: {«Text»: «GSE53312″, «term_id»: «53312», «extlink»: «1»}} GSE53312 et {«type»: «entrez-Geo», «attrs»: {«Text»: «GSE37030″, «term_id»: «37030», » extlink «:» 1 «}} GSE37030; Satpathy et coll., 2012; KC et coll., 2014) ou par le consortium Immgen (GEO accession no. {«type»: «entrez-Geo», «attrs»: {«Text»: «GSE15907″, «term_id»: «15907», «extlink»: «1»}} GSE15907; Heng et coll., 2008) ont été analysés. Les données du tableau génique ont été traitées à l`aide de la normalisation quantitative moyenne des quantiles, et les données ont été modélisées à l`aide du logiciel ArrayStar (DNASTAR). Nous remercions le consortium ImmGen pour l`utilisation de l`ImmGen database110 et le Alvin J. Siteman Cancer Center à l`Université de Washington à St. Louis pour l`utilisation du centre d`informatique biomédicale et l`analyse génique multiplex GeneChip Core Facility. Ce travail a été appuyé par l`Institut médical Howard Hughes, les instituts nationaux de la santé (AI076427-02) et le ministère de la défense (W81XWH-09-1-0185; à l. a.
Murphy); l`American Heart Association (12PRE8610005; to A.T. Satpathy); et la Fondation allemande de la recherche (AL 1038/1-1; à J.C. Albring). Le Alvin J. Siteman Cancer Center est soutenu en partie par le National Cancer Institute Cancer Center Grant subvention #P30 CA91842. Nous avons précédemment suggéré que la définition exacte de la lignée cDC pourrait bénéficier de méthodes basées sur des facteurs de transcription spécifiques à la lignée induits au cours de ces premiers stades d`engagement (Satpathy et coll., 2011). Plusieurs facteurs de transcription ont déjà été trouvés pour réguler le développement de DC (Satpathy et al., 2011), mais ne sont pas appropriés dans le but de marquer spécifiquement la lignée in vivo. Par exemple, les souris Irf8 −/− manquent de pDC ainsi que les lignées de CD8α + cDC mais ont également des défauts supplémentaires dans d`autres types de cellules immunitaires (Schiavoni et al., 2002; Wang et Morse, 2009). De même, le facteur de transcription Batf3, qui est nécessaire pour le développement de la lignée des cDC CD8α +, est exprimé dans les cDCs, mais aussi dans d`autres cellules myéloïdes (Heng et Painter, 2008) et des cellules de l. a différenciées (Hildner et coll., 2008). Pour les échantillons de plantes, 1 g d`échantillon séché a été digéré avec le HClO4 et le taux de 5:1 jusqu`à ce qu`une solution transparente ait été obtenue, et les digère de plantes ont été filtrés et dilué à 30 ml, avec de l`eau distillée (Reddy et al.) [32].
les filtrats de la plante ont ensuite été évalués en utilisant la spectroscopie d`absorption atomique (AAS; GBC make — modèle avanta PM) pour l`analyse du Pb, du CD, du Cu, du CR, du mn et du Zn. La valeur AAS du blanc (sans échantillon) de chaque métal a été déduite de la valeur de l`échantillon pour les calculs finaux [26]. Toutes les analyses ont été faites avec trois réplications. Nous avons évalué l`expression de tous les membres de la famille RAB présents dans le génome de la souris 430 2,0 microarrays (Satpathy et coll., 2012; KC et coll., 2014) pour l`expression dans CD8α + DCs, CD8α − DCs, et les progéniteurs DC communs (CDPs; Fig. 1 A; Naik et coll., 2007). Rab43 a été parmi les protéines de RAB les plus fortement exprimées dans CD8α + DCs par rapport aux CDPs et CD8α − DCs.